العودة     كيف تقرأ نتيجة جينية ( عرض نظري و تطبيقي على التحور fgc1695 ، و خطوطه الجينية)


كيف تقرأ نتيجة جينية ( عرض نظري و تطبيقي على التحور fgc1695 ، و خطوطه الجينية)


كيف تقرأ نتيجة جينية ( عرض نظري و تطبيقي على التحور fgc1695 ، و خطوطه الجينية)


إضافة رد
 
أدوات الموضوع انواع عرض الموضوع
قديم 05-16-2015, 05:56 AM   #1
صائد الشوارد غير متواجد حالياً صائد الشوارد
عضو مميز


رقم العضويـــة: 466
تاريخ التسجيل: Aug 2010
المشاركــــات: 2,167
آخر تواجــــــد: ()
المشاهدات: 16072 | التعليقات: 16

كيف تقرأ نتيجة جينية ( عرض نظري و تطبيقي على التحور fgc1695 ، و خطوطه الجينية)


بسم الله الرحمن الرحيم

كيف تقرأ نتيجة جينية ؟


كثير ممن تظهر نتائجهم الجينية يرغبون في تحديد موقعها الجيني .. و يضطرون لمراسلة هواة هذا العلم ..
و بعضهم يكتفي بما يقوله من استشاره ، و بعضهم يرغب أن يصل إلى أعمق من ذلك وهو (كيف وصلت أيها القارئ لهذه القراءة )

و هنا أحاول تسطير بعض ما اكتسبته من خبرة أساتذتي خلال الخمس سنوات الماضية ..


1ـ كلما كانت النتيجة 111 ماركرز او 67 ماركرز كلما استطاع القارئ للنتيجة أن يستخرج منها معلومات أفضل .

2ـ يحتاج قارئ النتائج إلى إلمام بالخط الجيني الذي يقرؤه من حيث :

ـ المودل العام للسلالة التي يقرؤها .
ـ الخطوط الجينية التي تتفرع من هذا الخط العام (الخط الجيني : كل خط يتميز بماركرات مميزة خاصة .. وقد يكون له تحور يميزه ، أو يكون له تحور فرعي من دون وجود ماركرات مميزة تجمع أصحابه )
ـ النتائج التي تندرج تحت هذه السلالة المقروءة .

و تكتسب هذه الامور من خلال كثرة المقارنة و السبر للنتائج .


وهنا تطبيق لقراءة نتائج السلالة j1c3d و تحت التحور fgc1695

و كل خط أو سلالة يمكن تطبيق الخطوات التالية عليها بشكل عام .


الخطوات التي تحتاجها في قراءة النتيجة :

أولا : تحديد اتجاه النتيجة بشكل عام :

لتحديد اتجاه النتيجة وهل هي تتجه نحو التحور fgc1695 ينبغي لقارئ النتائج أن يكون ملما بالمودل العام لهذا التحور .(سيتم عرض المودل عند العرض التطبيقي لكيفية تحديد خط جيني )

ملاحظة : المودل العام للتحور fgc1695 قد يتشابه مع الخطوط التحورية القريبة منه ، لكن في الغالب بعد دراسة العينة لماركراتها المميزة سيتضح لك أنها ضمن خط من خطوط التحور fgc1695 .. و بعض العينات لا يتضح الا بالفحص التحوري .



ثانيا : قم بجمع العينات التي تشترك مع العينة المدروسة في ماتشات الـ 67 او الـ 111 ماركر (ملاحظة: قد تجتمع عينات مع العينة المدروسة في البصمة المميزة ، لكنها لا تظهر في الماتشات ، لكن وضعت هذه الخطوة كتبسيط للمعلومة ، و لتقليل احتمال الخطأ)


ثالثا : من خلال العينات التي اشتركت مع العينة المدروسة في ماتش الـ 111 او الـ 67 ماركر قم بالتالي:
1ـ حدد القيم المميزة للعينة المدروسة و التي خالفت المودل العام للتحور fgc1695
2ـ حدد العينات التي اشتركت جميعها في قيم مميزة موجودة ضمن القيم المميزة للعينة المدروسة.
3ـ استبعد العينات التي لا تتشارك مع العينة المدروسة في القيم المميزة التي شاركتها بقية المجموعة .


النتيجة : هي أن تلك العينات التي تشارك النتيجة في قيمها المميزة تعطي مؤشرا أن هنالك علاقة جد جامع اجتمعت فيه هذه القيم المميزة و أورثها لأحفاده .

وهناك مؤشرات لتحديد قوة الماركرات المميزة في إثبات علاقة جد جامع وهي :

ـ عدد الماركرات المميزة : فبعض الخطوط الجينية تكون ماركراتها المميزة كثيرة ، وبعضها قليلة .. و كلما كانت الماركرات المميزة كثيرة كلما قلت احتمالية تشابهها و تداخلها مع خطوط أخرى .

ـ نوع الماركرات المميزة : يختلف تغير التردد في الماركرات الى بطيء ، و متوسط ، و سريع .. فكلما كان بعض الماركرات المميزة من النوع البطي أو متوسط السرعة كلما أعطى قوة في دلالته.

ـ نوع التغير في الماركرات المميزة : التغير في التردد عن المودل العام قد يكون بخطوة للاعلى او خطوة للأسفل ، و قد يكون بأكثر من ذلك

مثلا : إذا كان الماركر تردده في المودل العام 12 ووجد في النتيجة المدروسة 13 فهذا تغير للأعلى بخطوة واحدة ، و إذا كان 11 فهو تغير للاسفل بخطوة واحدة ، و إذا كان 14 فهو تغير للاعلى بخطوتين ، و إذا كان 10 فهو تغير للاسفل بخطوتين .
فإذا كانت بعض القيم المميزة تغيرت إلى خطوتين للاعلى او للاسفل فهذا يعطي قوة للماركرات المميزة لهذا الخط .


لذا فالماركرات المميزة دليل ترجيحي .. و ليست دليلا قطعيا ، و كلما كانت تلك الماركرات المميزة محققة لتلك المؤشرات السابقة كلما أعطت ثقة في المعلومة التي نستنبطها منها .


رابعا : أبحث عن العينات المشاركة في الفل جينوم و البق واي للخط الذي حددت ماركراته المميزه لتتعرف على موقعه التحوري .
و ذلك من خلال مشجرة فيكتار .
أو من خلال مشجرة الأستاذ أبو حسن :
http://j1tree.com/myfiles/fg_snp.htm




هذا عرض نظري لكيفية اكتشاف خط جيني و العينات التي تندرج تحته ، و يتبع ذلك بإذن الله عرض تطبيقي لأغلب الخطوط الجينية تحت التحور fgc1695 .. حيث سأختار كل أسبوع خطا جينيا ، و أطبق عليه الخطوات السابقة .
________________________________________

+J1c3d2 == L222
  رد مع اقتباس
قديم 05-16-2015, 07:10 AM   #2
الوشق911 غير متواجد حالياً الوشق911
مشرف عام

الصورة الرمزية الوشق911

رقم العضويـــة: 810
تاريخ التسجيل: Apr 2011
المشاركــــات: 1,498
آخر تواجــــــد: ()

موضوع مميز يا أستاذنا صائد الشوارد و الساحة الجينية كانت بحاجة لمواضيع تثقيفية في هذا العلم نأمل تثبيت الموضوع و ننتظر الحلقات القادمة و نأمل جعل الأسئلة من قبل الإخوة المتابعين بعد الإنتهاء من شرح أستاذنا صائد الشوارد حتى يكون الموضوع مترابط و في سلسلة متصلة
  رد مع اقتباس
قديم 05-16-2015, 09:26 AM   #3
سلمان37 غير متواجد حالياً سلمان37
عضو مميز


رقم العضويـــة: 3220
تاريخ التسجيل: Feb 2015
المشاركــــات: 446
آخر تواجــــــد: ()

بارك الله فيك
دايم علومك طيبه ومفيده

اذا امكن ترفق لنا المتنبئ السلالي حتى يسهل للاخوه المستجدين
حاولت انزله بس ماقبل الموقع
HG Predictor.exe
________________________________________

الحمدوالشكر لواسع الفضل
  رد مع اقتباس
قديم 05-16-2015, 11:47 AM   #4
العتبي غير متواجد حالياً العتبي
عضو مميز


رقم العضويـــة: 1831
تاريخ التسجيل: Oct 2012
المشاركــــات: 431
آخر تواجــــــد: ()

موضوع لو كان موجود قبل ٣ سنين لاراحني كثيرا هههههههه

جزاك الله خير استاذنا

ومنتظرين العرض التطبيقي
________________________________________



‏وَمَا تَشَاؤُونَ إِلَّا أَن يَشَاء اللَّهُ رَبُّ الْعَالَمِين

صدق الله العظيم
  رد مع اقتباس
قديم 05-16-2015, 11:56 AM   #5
ابومحمدج غير متواجد حالياً ابومحمدج
عضو مميز


رقم العضويـــة: 2761
تاريخ التسجيل: Apr 2014
المشاركــــات: 127
آخر تواجــــــد: ()

من أجمل المواضيع التي مررت بها ...
موضوع مفيد جدا ... من أخ استفدنا منه كثيرا
لآ عدمناك يا صائد الشوارد
  رد مع اقتباس
قديم 05-16-2015, 12:35 PM   #6
ابو حسن غير متواجد حالياً ابو حسن
باحث


رقم العضويـــة: 31
تاريخ التسجيل: Apr 2010
المشاركــــات: 2,416
آخر تواجــــــد: ()

إستمر بارك الله فيك وستنقل كمقالة في الموسوعة لاحقاً
________________________________________



أعلل النفس بالاّمال أرقبها *** ما أضيق العيش لولا فسحة الأمل


  رد مع اقتباس
قديم 05-16-2015, 02:20 PM   #7
هاوي الجينات الوراثية غير متواجد حالياً هاوي الجينات الوراثية
عضو نشيط


رقم العضويـــة: 2730
تاريخ التسجيل: Apr 2014
المشاركــــات: 73
آخر تواجــــــد: ()

اجمل واهم موضوع قرأته في ساحات الحمض الجينية

ومن يوم فحصت في بداية ٢٠١٤ وانا انتظر موضوع شافي كافي

وخطوة جميلة جدا وتخفف الضغط على اساتذتنا من طلبات تحليل النتيجه
  رد مع اقتباس
قديم 05-16-2015, 02:26 PM   #8
هاوي الجينات الوراثية غير متواجد حالياً هاوي الجينات الوراثية
عضو نشيط


رقم العضويـــة: 2730
تاريخ التسجيل: Apr 2014
المشاركــــات: 73
آخر تواجــــــد: ()

نرجو من الادارة الكريمة التثبيت

حيث ان الفاحص اهم شي عنده تحليل نتيجته لاقرب الناس له

جزاك الله خيرا اخوي صائد الشوارد
  رد مع اقتباس
قديم 06-09-2015, 08:08 AM   #9
نجدي قطري غير متواجد حالياً نجدي قطري
عضو نشيط


رقم العضويـــة: 3154
تاريخ التسجيل: Dec 2014
المشاركــــات: 50
آخر تواجــــــد: ()

سعادة الحبيب صائد الشوارد بارك الله فيك على هذا الشرح

واذا ممكن تعيد كتابة المقال مع الصورة والشرح

حتى يكون الفاحص الجديد

الغير عارف بالمصطلحات الانجليزية

يعرف كيف يتعامل مع المصطلحات المذكورة

واين توجد في صفحة كل واحد منا

ولكم جزيل الشكر
  رد مع اقتباس
قديم 09-15-2015, 06:42 AM   #10
رمضان غير متواجد حالياً رمضان
عضو جديد


رقم العضويـــة: 3445
تاريخ التسجيل: Jun 2015
المشاركــــات: 7
آخر تواجــــــد: ()

جزاك الله كل الخير و الثواب شـكــ وبارك الله فيك ـــرا لك ... لك مني أجمل تحية .
  رد مع اقتباس
إضافة رد

أدوات الموضوع
انواع عرض الموضوع

تعليمات المشاركة
لا تستطيع إضافة مواضيع جديدة
لا تستطيع الرد على المواضيع
لا تستطيع إرفاق ملفات
لا تستطيع تعديل مشاركاتك

BB code is متاحة
كود [IMG] متاحة
كود HTML معطلة

الانتقال السريع

الساعة الآن 12:20 AM.



Powered by vBulletin® Version 3.8.9
Copyright ©2000 - 2018, Jelsoft Enterprises Ltd.
(Valid XHTML 1.0 Transitional | Valid CSS! | SEO) .
For best browsing ever, use Firefox.
جميع المشاركات المنشورة تمثل وجهة نظر كاتبها فقط، ولا تمثل بأي حال وجهة نظر المنتدى و إدارته